根据权威性和时效性较高的信息源，琼瑶最具代表性的三部小说如下：

《烟雨濛濛》

- 主题：

以爱情悲剧为核心，描绘了何书桓、陆依萍、傅文佩三人之间的三角纠葛，展现了爱情中的甜蜜与苦痛。 - 特色：细腻的情感刻画与历史背景的融合，被赞为“写给爱情的哀歌”，是琼瑶最具影响力的作品之一。

《苍天有泪》

- 主题：

聚焦家族兴衰与命运抗争，通过爱情故事反映社会变迁，探讨人性与宿命。 - 特色：宏大的叙事结构与深刻的情感张力，是琼瑶中后期创作的巅峰之作。

《庭院深深》

- 主题：

以传统家族为背景，讲述章含烟与柏霈文的爱情纠葛及家庭和解，展现传统与现代的冲突。 - 特色：现实与追忆交织的叙事手法，开创了琼瑶“庭院系列”的经典风格。

注：

早期作品如《窗外》《我的故事》虽情感真挚，但权威性较高的榜单中未列入前三。- 《失火的天堂》等作品因出版时间较早或评价分散，未进入核心推荐。