刘裕仅当了二年皇帝，主要原因如下：

健康原因早逝

刘裕于422年6月病逝，享年59岁，统治时间仅1年零10个月（元熙二年6月至422年6月）。其去世直接导致统治时间缩短。

继位者问题引发政局动荡

刘裕长子刘义符继位后，因顾命大臣不满其能力，最终被废并杀害。这一事件虽未直接导致刘裕下台，但暴露了其统治后期的内部矛盾，间接加速了政权更迭。

北伐未竟与后方不稳

刘裕在位期间忙于北伐，试图统一北方，但未能完成。同时，后方政权不稳，对手实力强劲，分散了其精力，导致统治时间缩短。

禅位后政治清洗

刘裕称帝后为巩固权力，诛杀了晋恭帝司马德文，但此举加剧了统治集团内部矛盾，为其早逝埋下隐患。

综上，刘裕早逝是统治时间短暂的核心原因，后续政治动荡和北伐失利进一步削弱了其统治基础。